Af vedtægterne for Nordjyske Museer fremgår det, at Museets bestyrelse har 7 medlemmer.

3 medlemmer vælges af de kommuner, der i fællesskab driver den selvejende institution Nordjyske Museer. Der vælges foruden repræsentant til bestyrelsen fra de 3 kommuner (Aalborg, Mariagerfjord og Rebild) ligeledes personlige suppleanter alle med gyldighed for en kommunal valgperiode.

1 medlem og 1 personlig suppleant vælges af medarbejderstaben med en gyldighed for 4 år.

1 medlem og 1 personlig suppleant vælges af de foreninger, der udgør museets repræsentantskab for 4 år.

2 medlemmer udpeges af de ovenfor nævnte medlemmer af bestyrelsen. Disse to bestyrelsesmedlemmer skal repræsentere erhvervsinteresser og/eller kompetencer, som den øvrige bestyrelse finder, kan gavne museets virke. Udpegningen af disse to medlemmer er gældende for 4 år første gang fra 1. januar 2026. 

Bestyrelsen konstituerer sig med formand og næstformand. Disse kan sammen med yderligere 1 repræsentant fra bestyrelsen udgøre et forretningsudvalg, som mellem bestyrelsesmøderne kan varetage bestyrelsens interesser. Bestyrelse og forretningsudvalg udarbejder selv sin forretningsorden. I tilfælde af stemmelighed i bestyrelsen er formandens stemme udslagsgivende. Museets direktør deltager i bestyrelsens og forretningsudvalgets møder. Stedfortræder for museets direktør fungerer som sekretær.

Byrådet skal jf. ovenstående udpege et medlem til Nordjyske Museers bestyrelse. Byrådet har hidtil vurderet at det er hensigtsmæssigt, at Rebild Kommunes repræsentant i bestyrelsen har tilknytning til udvalget med ansvar for kultur og fritid.

For perioden 2022-2025 var Lene Aalestrup valt til bestyrelsen for Nordjyske Museer.